Muzeum Fortyfikacji i Broni Arsenał powstało na bazie Muzeum Barwy i Oręża w ramach projektu "Utworzenie Muzeum Fortyfikacji i Broni w obrębie Bastionu III i Arsenału w Zamościu" dofinansowanego ze środków Europejskiego Funduszu Rozwojowego i Regionalnego.
Jest to muzeum o tematyce militarnej, w którym można prześledzić rozwój sztuki wojennej od XVI wieku do połowy XX wieku poprzez ekspozycję broni i wyposażenie żołnierzy.
Muzeum mieści się w trzech obiektach: zrewitalizowanym Arsenale, zabytkowej Prochowni oraz nowoczesnym Pawilonie pod Kurtyną.
Oprócz gromadzenia i opracowywania zbiorów muzeum prowadzi działalność edukacyjną i wystawienniczą prezentując ekspozycję stałą i czasową.
Muzeum Fortyfikacji i Broni Arsenał jest oddziałem Muzeum Zamojskiego w Zamościu.