Kościół św. Szczepana należy do parafii ewangelicko-augsburskiej w Toruniu. Wybudowano go w latach 1902-1904 w stylu neogotyckim według projektu architekta Richarda Gansa z Berlina dla zboru ewangelicko-reformowanego założonego w 1676 r.
Kościół ma długość 25 m, szerokość 11,5 m, wieża ma wysokość 49,5 m. Jest to budowla dwunawowa, z płytkim prezbiterium zwróconym na zachód i z wieżą w narożniku płn.wsch. Podczas trwania II wojny światowej kościół został częściowo zniszczony, a następnie przekazany parafii ewangelicko-augsburskiej i po renowacji ponownie poświęcony 26 sierpnia 1945, otrzymując obecną nazwę.
Co ciekawe podczas prac remontowych w 2013 r. na wieży kościoła znaleziono ukrytą pod podłogą po 1945 r. tablicę z drewna dębowego z 1918 r., poświęconą poległym na frontach całej Europy parafianom ze znanych rodzin kalwińskich. Znajdują się na niej 4 nazwiska, takie jak: Rudolf Lüttmann, Erich Tarrey, Walter Raapke i Werner Szemjonneck.
Kościół jest otwarty głównie podczas niedzielnych nabożeństw. Wtedy też można zobaczyć wnętrze świątyni wraz z XVII-wiecznym manierystycznym obrazem Adoracji Baranka Apokaliptycznego.
