Opera krakowska powstała w 1954 roku i początkowo zajmowała skromną salę Domu Żołnierza przy ul. Lubicz 48. Opera nie miała jednak własnej siedziby i spektakle operowe odbywały się w Teatrze im. J. Słowackiego w Krakowie, repertuar operetkowy grano natomiast na amatorskiej scenie przy ul. Lubicz.
Nowy gmach Opery został wybudowany w latach 2004-2008 ze środków Unii Europejskiej przy wsparciu Województwa Małopolskiego i Ministerstwa Kultury i Dziedzictwa Narodowego. Scena zaczęła działać w dniu 13 grudnia 2008 i zapoczątkowane to było uroczystą premierą Diabłów z Loudun Krzysztofa Pendereckiego w reżyserii Laco Adamika pod kierownictwem muzycznym Andrzeja Straszyńskiego.
Obecnie Opera Krakowska ciągle poszerza zakres swoich działań. Wystawiane tu przedstawienia przyciągają widzów z całego kraju i z zagranicy. Instytucja charakteryzuje się wysokim profesjonalizmem wykonawców i realizatorów przedstawień. Wśród artystów zaangażowanych w pracę Opery należy wymienić : Małgorzatę Walewską, Mariusza Kwiecień, Andrzeja Dobbera, Łukasza Borowicza i wielu innych. Do wybitnych twórców tego miejsca należy również zaliczyć dyrygentów, reżyserów, scenografów i choreografów.
Repertuar Opery Krakowskiej opiewa obecnie na około trzydzieści tytułów. Znajdziemy tu dzieła kompozytorów polskich i klasykę światową, przedstawienia baletowe oraz muzyczne dla dzieci. Podczas sezonu odbywają się tu również koncerty, występy innych teatrów, spotkania z twórcami.
Placówka od kilkunastu lat organizuje także Letni Festiwal, prezentując własne spektakle w plenerach lub zabytkowych wnętrzach Krakowa i okolic. Prowadzone są tu również programy edukacyjne dla dzieci.
Opera współpracuje z Akademią Muzyczną w Krakowie, swoje debiuty odbywają tu studenci krakowskiej uczelni.